Silikonové polymerní molekuly polymeru jsou řetězové struktury tvořené vazbami Si-O (křemíkovým oxygenem) a jejich hlavní složkou je lineární polysiloxan s vysokou molární hmotností. Protože vazba Si-O-SI je jeho základní typ vazby, atomy křemíku jsou spojeny hlavně s methylovými skupinami a do postranních řetězců je zavedeno velmi malé množství nenasycených skupin.
Mezimolekulární síly jsou malé a molekuly mají spirálovou strukturu. Methylové skupiny jsou uspořádány směrem ven a mohou se volně otáčet, což způsobuje, že silikonová guma má lepší tepelnou odolnost, elektrickou izolaci, chemickou stabilitu atd. Než jiné běžné kaučuky.
Typická silikonová guma, jmenovitě polydiformní siloxan, má spirálovou molekulární konfiguraci s relativně malými intermolekulárními silami, čímž má vynikající odolnost. Mezitím se skupiny formaldehydů směřujících mimo spirálu mohou volně otáčet, což si silikonové gumy odoluje jedinečnými povrchovými vlastnostmi, jako je hydrofobita a povrchová nestřízlivost
